正徳三年（1713）、もともと求聞持法の霊場として知られた長谷寺に、求聞持堂がないことを憂えた常陸国水戸の宥仲、寛海という二人の僧によって、建立された。本尊は虚空蔵菩薩だが非公開で、現在 ではもっぱら、明治時代に中興第一世の海如によって建立された「日限地蔵」の御利益で知られている。
『豊山玉石集』（祐厳、宝暦十年 1761）「水巻」には、「能満諸願の寺なればとて、能満院と名付け、本尊の供物を調へ、行者の休憩とす」とある。本堂の東北方わずか「数百歩」にあるが、「峻 嶺に傍ひ、深谷に臨む。蕭々たる松の風は浮世の塵を遠ざけ、冷々たる水の流れは妄想の垢を滌ぎ、寔に経軌の説にかなへる禅寂の道場」であるとしている。

十一面観音図じゅういちめんかんのんず
 重要文化財  絹本著色、116.6cm×58.8cm  鎌倉時代（14世紀初）

地蔵十王図じぞうじゅうおうず
 重要文化財  絹本著色、100.9cm×51.5cm  鎌倉時代